2002年单位同意职工自建房但没有办理房产证，可以通过以下步骤来补办：

申请登记：

向当地的房地产登记部门提出房屋所有权登记申请，并提交能够证明房屋权属的相关材料1。

提交必要文件：

包括土地使用证、建设工程规划许可证、房屋平面图等2。

如果自建房已经合法化并已获得建设许可证等证件，可以向当地的房地产管理部门申请补办房产证3。

审核和实地勘察：

接受当地房地产行政主管部门的实地勘察和审核2。

补办相关手续：

如果因为历史原因或其他特殊情况未办理相关手续，可咨询当地房地产行政主管部门补办手续的具体流程2。

根据实际情况，可能需要补办土地使用证、规划许可证等手续2。

法律援助：

如果无法确定如何处理没有房产证的自建房问题，建议寻求法律援助2。

联系当地律师或法律援助机构，咨询相关法律法规和解决方案2。

通过上述步骤，可以完成2002年单位同意职工自建房的房产证补办流程。