区别如下： 1、颜色不同甘肃大红袍花椒果实颜色为青色、红色、紫红色，密生疣状凸起的油点；陕西大红袍花椒果实颜色为紫红色，散生微凸起的油点。
2、外观不同甘肃大红袍花椒颗粒大，比较饱满，外表凹凸不平；陕西大红袍花椒颗粒大小不一，外表有点凹凸不平。
3、成熟期不同甘肃大红袍花椒果实成熟期：7-9月份；陕西大红袍花椒果实成熟期：8-10月份。
不同的地理环境，造就了两地辣椒的不同，陕西的线辣子比甘肃的线辣子更辣一些。陇椒与秦椒在品种上有所差别，各有优势。炸辣椒的时侯，各有秘方，味道差别就大些了。
甘肃辣椒辣不辣与辣椒素含量多少相关。
辣椒有很多品种，不同的辣椒品种之间所含的辣椒素的量差异是很大的。辣椒素是辣椒的一种武器，它们在潮湿的生长环境中会产生很多的辣椒素，来保护自己免受环境中真菌的攻击。所以在气候比较潮湿的环境中生长的辣椒口感会辣一些。
在不同的生长环境中，就算是同一种辣椒，产生辣椒素的量也是不同的。像菜椒，在我国南方和北方都有种植。在南方，其生长环境较为潮湿，而北方就比较干燥。所以北方菜椒的果实不辣还带的甜味，而在南方收获的菜椒会稍带点辣味。