这个问题是这样的，公司更改劳动合同降低社保公积金当然是不合法的，劳动合同约束的是劳资双方的，不可以单方面变更的，公司这种做法肯定是一种违约行为了。
不合法。劳动合同已经签订就具有法律效力，劳资双方都必须遵守，公司不经劳动者同意，擅自修改劳动合同的相关社保及公积金的交纳标准约定条款，是一种违法行为，劳动者可以申请劳动仲裁。
答：1.公司垫付：公司先垫付认证费用，员工在后续的工资中逐步偿还。
2.公司直接支付：公司直接支付认证费用，不需要员工偿还。
3.员工自费：员工自己支付认证费用，公司提供必要的支持和协助。