鸽子毛滴虫和体内虫是两种不同的寄生虫，它们的寄生部位和感染方式也不同。因此，清理这两种寄生虫需要采用不同的方法和药物。
一般来说，鸽子毛滴虫可以通过给鸽子喂食含有特定药物的饲料或者喷洒药物来清除。而体内虫则需要使用其他种类的药物，如驱虫剂等。因此，如果鸽子同时感染了这两种寄生虫，需要分别采用不同的方法和药物进行清理。
甲硝唑本身是用于治疗人类滴虫性病菌感染，而鸽子同样会出现毛滴虫感染清理，运用甲硝唑来治疗鸽子的毛滴虫病菌效果十分显著，一般鸽子专用药物的作用根本没有甲硝唑明显，所以鸽友们都会在鸽子感染毛滴虫病菌的时候使用甲硝唑来治疗和控制病菌的蔓延和发展，甲硝唑也一度成为了治疗毛滴虫最有效的药物之一。