因为地理位置原因所以中吉乌铁路不经过塔吉克斯坦
中吉乌铁路途经中国、吉尔吉斯坦、乌兹别克斯坦，再往西经过土库曼斯坦，甚至土耳其、伊朗、高加索、格鲁吉亚等等
这是因为北线经过吉尔吉斯斯坦的城市较多，且连通了吉尔吉斯斯坦的经济腹地，有利于吉尔吉斯斯坦的经济发展。
而南线方案，则只是连接了吉尔吉斯斯坦的很少几个小城镇，对吉尔吉斯斯坦的经济带动不强。
大概需要七年，因为那一片地方地形复杂，修建铁路需要穿越山岭，而且又处于帕米尔高原上，地质条件复杂，所以修建铁路有难度，需要较长时间。