从奶制品中提取出来的，酸奶中常见的益生菌主要是保加利亚乳杆菌、嗜热链球菌、嗜酸乳杆菌、双歧杆菌、干酪乳杆菌、鼠李糖乳杆菌。

保加利亚乳杆菌和嗜热链球菌是酸奶的基础发酵菌，酸奶的粘性和酸度，就是这两种菌的相互作用结果。