1、吉林电子信息主校区和东校区是分别位于吉林省吉林市船营区和绿园区的两个校区。

2、两个校区拥有不同的教学楼、图书馆、宿舍楼等基础设施，但都拥有先进的教学设备和舒适的住宿条件。

3、主校区拥有更多的学科专业，相比之下东校区主要是偏向信息技术和软件专业，同时也拥有着一些研究和实验室。

4、两个校区的交通状况也稍有不同，主校区在市中心的位置相对更加便利，而东校区在市郊地区，相对出行可能稍微麻烦一些。

所以，两个校区的区别在于地理位置、专业设置和基础设施等方面。