第一，适用的范围不同。审批制只适用于政府投资项目；核准制则适用于企业不适用政府资金投资建设的重大项目和限制类项目；备案制适用于企业投资的中小项目。

第二，审核的内容不同。审批制是政府对投资项目的全方位审批，而核准制只是政府从社会和经济公共管理的角度审核，比如审核项目的资源利用和能源消耗、生态环境影响以及社会效果等，不再负责考虑企业投资项目的市场前景、资金来源、经济效益等因素。

第三，程度环节不同。审批制一般要经过项目建议书、可研报告、初步设计等多个环节，而核准制、备案制只有项目申请核准或备案一个环节。