深圳湾口岸过关后的交通接驳非常方便，而位置临近于南山以及宝安区，日均流量高达8到10万人次。
口岸规划设计其实已经充分考虑到停车问题了，附近有A、B、C、D四个专用停车场，稍远一点还有免费停车场。
地铁：旅客出联检大楼北出口，沿通道前进180米→旅游大巴/地接驳公交停靠区→乘坐接驳公交抵达12号晓南油、2号线海月等地铁站。
巴士：沿北出口通道前几年150米→深圳湾天桥前进400米→公交别停靠区。
的士：沿北出口通道前进120米→的士停靠区。
网约车：沿北出口通道前进150米→深圳湾天桥前进350米→乘坐垂直电梯抵达社会车辆（网约車）停靠区。
深圳湾口岸有直通澳门的车辆服务。乘客可以乘坐跨境巴士从深圳湾口岸直接到达澳门，这种服务为乘客提供了便捷的出行选择。
乘客可以在口岸直接购买车票或提前预订，然后通过海关检查后，轻松地乘坐巴士到达澳门，大大减少了行程中的等待和转乘时间。
这种直通车辆服务能够满足乘客的出行需求，提供了更加便捷和舒适的旅行体验。