枸杞含糖量高，易吸潮、泛油、发霉和虫蛀；而且其成分的色质也极不稳定，容易变色，影响枸杞外观及品质。

通常的直接存放很难将干枸杞妥善保管，需要采取一定措施，才能使其达到防潮、防虫、防霉的目的。

一般比较有效简便的保存方法有：;

1.乙醇保存法：将枸杞用乙醇喷雾拌匀，然后用无毒性的塑料袋装好，排除空气，封口存放，随用随取。

此种方法既可防止虫蛀，又可以使其色泽鲜艳如鲜品；

2.塑料袋真空保存法：把除净杂质的枸杞子装进密封的塑料袋里，排尽空气，扎紧袋口以防漏气，放置在阴凉干燥处保存。

有条件的，可在塑料袋中放入装有适量生石灰的小麻袋，效果更好；

3.冷藏法：将枸杞子置于冰箱或其它的冷藏设备中0至4℃保存，此法是简单、实用的一种贮藏方法；

4.矿泉水瓶保存法：把枸杞装到干净的矿泉水瓶中，拧紧瓶盖，随用随取，短期内可以达到防虫防潮的目的；

5.霉变处理方法：将霉变的枸杞子置于圆簸箕中，双手将结块者搓散，弃去严重变质者，喷淋适量白酒，湿润表面白斑处，双手搓除斑，反复多次，直至无斑。

然后用微火焙干，并常用手轻搓翻动，使之散发水汽，出锅过筛，然后密封保存。