拼多多商家运费基本由商家承担，但也存在扣除商家运费的情况。
根据拼多多的规定，当商家在交易中出现重复退货、买家收换货、质量赔付等情况时，拼多多有权从商家退款中扣除相应的运费。
同时，如果商家使用了拼多多平台提供的营销服务，那么在促销活动期间，商家也需要自行承担部分运费。
需要注意的是，商家的运费扣除应该在交易完成之后进行。
商家可以在拼多多平台上查看自己的账户余额，了解扣除的运费明细。
因此，商家需要在拼多多平台上清晰了解商家运营规则并合理运营，以避免扣除不必要的运费。
1 拼多多规定商家需要自行承担商品的运费，但是在促销活动等特殊情况下，拼多多会对商家的运费进行一定的补贴。
2 因为拼多多作为一个社交电商平台，其独特的模式和低价策略使得平台需要吸引更多的商家入驻，而商家可以自行承担商品运费可以让平台获得更多的商家信任和支持。
3 商家在加入拼多多之前需要了解并同意平台的运费规定，同时也需要结合自己的经营状况和利润情况进行决策。