协商解除劳动合同是否有补偿，要看具体的情况。根据《劳动合同法》的规定，如果用人单位依照本法第36条规定的情形，向劳动者提出解除劳动合同，并且与劳动者协商达成了一致，这种情况下需要支付补偿金。
但要是由劳动者主动提出解除劳动合同，经过协商之后双方达成一致，这种情况下可以不支付补偿金。
双方协商一致不能定义为自动离职。属于协商解除劳动关系，双方对离职补偿，工资结算，工作移交，执行时间等方面均取得了一致意见，但因为协商解除劳动关系大多是用人单位主导，所以用人单位应为当事人出具被动失业证明，便于劳动者到就业部门登记失业并办理失业补助事宜。