公积金缴存同社保一样，以缴存人个人上年度月均工资为基数（年中入职的以劳动合同约定工资额为基数），以缴存地上年度在岗职工月平均工资标准300％为上限，以缴存地最低工资标准为下限。
公积金差额补缴，是指此前的公积金缴存基数低于缴存人上年度月平均工资额，按基数差额计算月度缴存差额，并补缴相应月份缴存金额。
就是你的公积金基数上调了，所以要补差额看你的工资单，单位是按你月工资的5%已经扣除了住房公积金，也按单位的2倍补贴，问题应该出在公积金查询记帐方面，可以咨询你们当地公积金管理部门，最后以你每年金6月份发放的公积金对账单为准。