灵活就业保险扣费是需要再补的。

原因是灵活就业保险是一种社会保险制度，旨在保障灵活就业人员的基本权益和社会福利。

根据相关规定，灵活就业人员需要按照一定比例缴纳保险费用，以享受相应的保险待遇。

如果灵活就业人员的实际收入超过了规定的缴费基数，那么就需要根据超过部分的收入额再补缴相应的保险费用。

灵活就业保险的补缴是为了确保灵活就业人员能够享受到全面的社会保险待遇。

通过缴纳保险费用，灵活就业人员可以获得医疗保险、养老保险、失业保险等多项保障，提高自身的社会保障水平。

因此，灵活就业人员在缴纳保险费用时，需要根据自身实际情况进行准确计算，确保缴费金额的准确性，以免影响到自身的保险待遇。

同时，也需要及时了解相关政策和规定的变化，以便及时调整自己的缴费情况，确保享受到应有的保险权益。