深圳地铁并不像一些大型火车站或机场等设有室外供短时间停留的便池，一旦出站需要重新购票或使用IC卡进站，所以没有设立不出站的公共厕所。但是，许多深圳地铁车站内部都有供乘客使用的厕所，如果需要使用，建议选择在车站内出站，进入厕所后再返回地铁站台。此外，一些商业中心场所如地铁口的购物中心、餐厅、酒店等也可作为解决厕所问题的选择。
深圳地铁中间间隔时间长是因为坐车的人比较少，出行人少的时段车的间隔往往会比较长，在一些人不是太多的地铁线路间隔往往也会比较长。
地铁线路的间隔时间是有行人的规模决定的，也是有出行的高峰时段和低谷时段决定的。当出行的人较多的时候，地铁线路的间隔时间就会缩短，出行人较多的地铁线会一直保持间隔时间较短，比如深圳的地铁一号线间隔就一直比较短。也有一些偏远的地铁线路，因为乘坐的人少，间隔就会比较长。