1、师资匮乏

国内开设STEM教育专业的高等院校并不多，校内的STEM课程一般是由其他科目的老师代上，校外培训机构的老师则多只是受过短期培训的应届毕业生或老师。他们对于STEM教育理念与体系并未有经过深入了解，授课时经常会按照传统课堂模式，孩子的创造力与探索能力得不到完全发挥，最后导致课堂收获事倍功半。

2、与升学及考试不对接

即使STEM教育发展飞快，但仍旧只被纳入课外课程，并不涉及孩子升学等相关，换言之就是STEM教育在目前并不算作教育刚需，在传统的教学环境下，学校内STEM教育的课时往往被严重压缩，大多以创客教室的形式出现；

3、教育体系混乱

STEM教育涵盖内容较多，由于刚刚进入国内教育市场不久，所以国内也尚未形成统一的STEM教育标准，校外的机构教研体系不成熟，产品线不完整，课程更新慢，课程产品也是良莠不齐。