1966年停办大学的主要原因是文化大革命的爆发。在这场运动中，大学被视为需要“彻底革命”的领域，因此受到了严重的冲击。具体来说，大学与国外高等教育发展脱离，接受和派遣留学生工作被强行停止；大学机构与中等教育机构的传统联系发生断裂，高考招生制度被强行废除；高深知识不再是联系大学内外部网络关系的主要因素，取而代之的是以“阶级斗争”为纲，宣扬“读书无用论”，停课闹革命，通过“斗批改”打倒“反动学术权威”，从而造成大学内外部关系极度混乱。

随着文化大革命的结束和高考制度的恢复，中国的大学开始逐渐恢复正常的教学活动。需要注意的是，文化大革命是一场被反革命集团利用，给党、国家和各族人民带来严重灾难的内乱，留下了极其惨痛的教训。