可以
交通银行卡是可以在农业银行自动取款机取钱的，但是不能在农业银行的自动取款机上存钱。
100块钱需要扣2元费用，因为一般跨行在取款机上取钱手续是2元一笔，然后在根据你所取金额剩费率就是要承担的费用，而且每天总取款金额不能超过2万元。
根据《银行卡业务管理办法》第二十六条 持卡人在ATM机跨行取款的费用由其本人承担，并执行如下收费标准：
（一）持卡人在其领卡城市之内取款，每笔收费不得超过2元人民币；
（二）持卡人在其领卡城市以外取款，每笔收费不得低于8元人民币。 从ATM机跨行取款所得的手续费，按机具所有行70%，信息交换中心30%的比例进行分配。