云之凡最后的结局是以男主角打败最终BOSS魔翳最后收场，虽说幕后的黑手被杀死了，但是作为男主角的爱人唐雨柔确实死掉了的额，云凡历经千辛万苦，虽救出生父姜世离，但无力挽救雨柔。
仙剑4中的魔剑分支剧情发生在游戏后期。主角可以选择跟随魔剑一方，以重新建立一个统治世界的秩序。
在这个分支剧情中，玩家需要与主线剧情中的角色对抗并征服四大家族，最终得到支配天下的魔剑。
但是，在这个决定之后，主角和魔剑之间的信任度将会变得很低，随后将会面临更大的挑战和风险。最终结局将完全不同于以前的结局。
由于姜云凡劝说姜世离无果，小蛮陪他回到蜀山，与蜀山七圣讨论如何应对净天教的攻击。当姜云凡恢复全部修为后，小蛮与姜云凡、龙幽统一战线，对抗姜世离和从神魔之井来到地面的魔翳。
在对抗过程中，小蛮爆发了女娲之力，现出蛇身。随后体力不支，晕倒在地。最后，这场大战随着姜世离和魔翳同归于尽而结束，龙幽也告别小蛮回到魔界;此时小蛮才发觉自己的心意，但也只能留在人间，与龙幽分隔两界。