莆田市人民政府是福建省莆田市的国家行政机关。现任市长林旭阳
1968年6月5日，闽侯专区革命委员会成立，行使原专区党政机构双重职能。
1970年6月，福建省革命委员会调整行政区划，从晋江专区划出莆田县、仙游县2个县革命委员会归闽侯专区革命委员会管辖，同时将闽侯专区革命委员会机关从闽侯螺洲迁移至莆田城关。
1971年5月，闽侯专区革命委员会更名为莆田地区革命委员会，恢复设置中共莆田地区委员会，与莆田地区革命委员会合署办公，地委书记兼任地区革委会主任。辖莆田、仙游、闽侯、闽清、福清、永泰、长乐、平潭8个县革命委员会。1973年9月，闽侯县革命委员会划归福州市革命委员会管辖。1978年3月起，莆田地区行政公署逐步取代莆田地区革命委员会。至1980年1月1日，正式撤销莆田地区革命委员会，启用莆田地区行政公署印章。莆田地区所属各县也先后撤销县革命委员会，恢复县人民政府。
1983年5至9月，莆田地区处在撤地建市的筹备阶段。1983年5月30日，莆田市筹备领导小组成立。9月9日，国务院批准成立莆田市。10月，莆田地区行政公署撤销，所属福清县、闽清县、永泰县、长乐县、平潭县划归福州市管辖。11月1日，莆田市人民政府正式成立，由福建省人民政府直辖，设市长1人、副市长3人，第一任市长、副市长由中共福建省委员会任命。辖莆田县、仙游县和城厢区、涵江区2县2区人民政府。12月，筹备领导小组终止工作。
1984年12月29日至31日，莆田市第一届人民代表大会召开，选举产生市人民政府市长1人、副市长4人。
1988年6月，福建省人民政府批准开辟湄洲岛为对外开放旅游经济区。1989年2月，湄洲岛管理委员会成立，为莆田市人民政府的派出机构。