上海企业职工参保登记后，缴费流程如下：

登录电子税务局，在首页的“我要办税”模块中选择“社保费办理”，然后在右侧弹出页面中选择“单位社保费缴费”模块。

在“单位社保费缴费”界面中选择申报日期及申报状态，点击查询。系统将已申报未缴款的社保费申报明细查出。

查看申报明细，点击“查看申报明细”，可以查询社保费申报明细信息。

如果申报有误，需要作废的，可以点击“作废申报”。

在“单位社保费缴费”界面，状态显示“已申报未缴款”，点击缴款，即可跳转至缴款界面。缴费人在缴费界面再次确认待缴金额无误后，选择缴款方式。企业可选择“三方协议扣款”、“银行端凭证缴税”、“银联在线缴费”、“第三方缴费”四种缴费方式。确认付款方式后，点击确定。

此外，对于初创企业或规模较小的公司，如果没有成熟的人事系统，可以选择将社保缴费工作外包给专业的企业社保代缴公司。这些公司可以代为缴纳社保，也可以帮忙开户、托管。这种方式可以省去繁杂的事项，让企业能够把更多精力放在主营业务上，同时也能减少人力支出。

请注意，以上信息仅供参考，具体操作可能因实际情况而有所不同。如有需要，建议咨询上海市社保部门或相关部门的工作人员。