从西面进入地下一层，乘手扶电梯上到地上两层，即是进站口了。先扫健康码，查看行程码，以前还要四十八小时核酸检测，后来就不要了，最近统一又要了。进站后是候车厅，左右都有电子屏，显示车辆信息，两边也都能上车。从车站启用以来，一直不怎么红火，原因就是车少，而且有的线路票价太高。
截至目前，没有收到菏泽高铁站停运的相关通知。菏泽高铁站是山东省内的重要交通枢纽之一，作为京沪高铁和徐兰高铁的交汇点，每天有多趟高速列车经过。因此，如果有停运情况，铁路部门和媒体都会及时发布公告通知，目前暂未有相关通知。但是，由于天气等原因，车站调整始发、终到站信息和运行时刻表的情况也是存在的，所以建议旅客及时关注官方公告和查询车票信息。