深圳医学科学院和深圳大学医学院是两个不同的机构。深圳医学科学院是由深圳市政府设立的，其性质为市政府举办的事业单位，实行党委领导下的院长负责制。该机构不定编制、不定级别，并实行社会化用人制度。
而深圳大学医学院则是深圳大学的一个二级学院，于2007年经深圳市人民政府批准成立。为了促进交叉学科的发展，原在深大信息工程学院的生物医学工程系也转入了医学院。
门诊统筹的门槛费(医保术语为起付标准)为300元,按年度累计计算,年度内参保人只承担一次门槛费。超过门槛费以上的合规医疗费用,由医保统筹基金报销
深圳医学科学院是深圳市政府批准成立的一所研究型医科院校，属于事业单位。主要功能是开展医学科学研究和人才培养，推动深圳医学和生命科学的发展。
深圳医学科学院将与深圳大学医学院、南方科技大学医学院一起，形成“三位一体”的格局，打造粤港澳大湾区医学教育和科技创新高地。