将蛋糕卷放入密封容器中，放入冰箱保存，最好在冰箱里保存不超过2天。如果有条件的话，可以将蛋糕卷冷冻保存，可以保持最长时间的新鲜度。在即将食用时，取出并放在室温下5-10分钟，让它回到它最好的状态。记得不要让蛋糕卷暴露在空气中，以免变硬和变干。
蛋糕卷一般不建议冷冻保存，因为冷冻会导致蛋糕卷变得干燥和口感变差。如果需要保存蛋糕卷，可以将其放在阴凉通风的地方，用保鲜膜或密封袋包装好，避免受到潮湿和氧化的影响。一般来说，蛋糕卷最好在制作后的24小时内食用完毕，以保持最佳的口感和风味。
蛋糕卷放在烤箱的中下层比较好，烤过蛋糕的都知道烤箱虽然小，也相对封闭，烤箱工作时密闭空间里的温度相差不大，但越靠近发热管温度还是会高点的，所以烤蛋糕卷的时候建议放中下层比较好，蛋糕卷表面是没有遮挡的，如果放太上面会容易烤焦或者是上面熟了底部没熟。