如实记录员工出勤时间。综合工时制是为了满足企业生产季节性旺盛的需求，而设置的一种工时制度，企业应说明理由后向行政管理部门提出申请，批准后才能实施。
按规定员工的加班时长和天数不能超出劳动合同法的规定，并且必须在指定的时间内安排综合均衡。所以其考勤方式应以实际出勤记录。
为实行全员工作时长不超过每周40小时的原则，与过去的计算工作时间不同，是基于每月工作时长，鼓励弹性工作，提高员工的工作效率和生产力。
同时，规定了工作超时的加班费和休息补偿等具体制度，以保障劳动者的合法权益。
该规定的出台符合时代需求和企业发展需要，从一个侧面促进企业优化组织架构和提高生产力。
虽然新规定可以鼓励员工自主控制工作时间，但是在实际应用中也需要注意避免加班压力过大导致员工身心健康问题，需要加强对企业和员工教育培训的实施。
不一定
一天上班12小时不一定违法，要根据具体情况来确定。根据《中华人民共和国劳动法》规定，劳动者每天工作时间不得超过八小时，每周工作时间不得超过四十四小时。但是存在特殊行业和特殊情况，符合条件的单位经劳动行政部门的批准，可以实行不同的工作和休息时间。如果工地经过劳动部门的审批，可以将工作时间切换至12小时，此时并不违反劳动法的规定。因此，一天上班12小时是否合法要根据具体工作情况来确定，需要用工单位在征得工会同意的前提下与劳动者协商延长工作时间，并经劳动部门批准。