不一样的。
1、参保人员不同
单位交社保(也就是我们所说的职工医保)，参保人员是在职的员工。自己交社保(也就是交居民医保)，参保人员主要是儿童、老年人、无业居民或自由职业者等。
2、缴纳的险种不一样
单位交社保是强制性，为职工缴纳五险，分别是养老
而自己交社保是自愿参加，主要是养老保险和医疗保险。根据相关规定，个人是无法缴纳其余的三险。
3、缴纳的费用和比例不一样
单位交社保后，上班族每月从工资条看到社保费扣了多少。养老保险、医疗保险和失业保险是由个人和单位分别按照比例缴纳，而工伤保险、生育保险的费用全部由单位缴纳，个人不需要交纳。(全国各地缴费比例有所不同。)
个人交社保只能缴纳养老保险和医疗保险，且所需社保费用都需要自行缴纳。
4、享受待遇不一样
一般来说，职工医保设立个人账户，每月都有一定金额的医疗费进账。此外上班族享有失业、工伤、生育三项保险待遇。
而居民医保不设立个人账户，也就没有医疗费进账。个人没有失业、工伤、生育三项保险待遇。
自己交的农合和公司五险不冲突。
1. 农合是农民社会保险，而公司五险是职工社会保险，两者的缴费机构和范围不同。
2. 农合是农民自行缴纳的社会保险，而公司五险是由公司为员工代缴的，两者的缴费方式和来源也不同。
3. 农合和公司五险的覆盖范围和保障内容也存在差异，农合主要针对农民的医疗保障，而公司五险包括养老保险、医疗保险、失业保险、工伤保险和生育保险等多个方面。
综上所述，自己交的农合和公司五险之间没有冲突，可以同时参保，获得更全面的社会保障。
答：办理个人医保停保的方法取决于您参加的是职工医保还是城乡居民医保。以下是两种情况下办理停保的步骤：
职工医保停保：
灵活就业人员可以通过经办机构门户网站申请或携带本人有效身份证件及证明材料到当地经办机构办理停保手续。
如果是个人报停医保，需要拿着本人身份证、户口本及医保卡去当地社保局窗口办理。
企业报停医保时，需要在社保网上输入企业账户名和密码，进行人员减少的业务提交申报，并去劳动局打印解除劳动合同证明书后到社保局办理减员。
城乡居民医保停保：
在各统筹区规定的参、续保期内未正常参保缴费的，下一年度会自动停保。