逾期自动扣款通常会给用户带来一定程度的困扰和风险，所以需要及时处理。以下是一些常见的处理方式：

1. 向银行申请暂停自动扣款服务。如果条件允许，可以向银行申请暂停自动扣款服务，直至借款人还清欠款或重新制定自动扣款计划。

2. 安排按期还款。逾期自动扣款后，最好尽快安排按期还款，以免再次逾期扣款，导致更多的罚款和利息等额外费用。

3. 联系借贷机构。如果无法及时还款，可以与借贷机构联系并说明情况，寻求可能的解决方案，例如延长还款期、免除部分罚息等。但需要注意的是，即使借贷机构同意延长还款期，也会产生额外的利息和罚款等费用。

总结起来，处理逾期自动扣款的方式主要有：暂停自动扣款服务、安排按期还款、联系借贷机构并提出合理方案等。对于借款人来说，及时还款是最好的方式，也可以最大限度地减少违约和额外费用的产生。