凝胶电泳技术利用凝胶材料的特性，将DNA、RNA、蛋白质等大分子生物分子按照尺寸和电荷大小差异进行分离和检测的方法。其原理主要有以下几个方面：

1.凝胶材料的筛选作用：凝胶材料本身是由一种或几种高分子物质构成的三维网状结构，其间隙大小和性质与生物分子的大小、形状和电荷密度有关。因此，不同的凝胶材料可对不同大小、不同形状和电荷密度的生物分子进行筛选作用，从而实现它们的分离。

2.电场作用：将生物样品加入凝胶，然后将凝胶浸泡在含有电解质的缓冲液中，在凝胶上施加电场，使带电生物分子在电场力的作用下沿着凝胶孔道向电极运动。大分子受到凝胶的阻拦，难以通过孔径，而小分子则能够通过孔径，从而实现了分离。

3.染色剂作用：通过染色剂如溴化乙锭等可以使DNA或RNA在紫外线或蓝光照射下发生瞬时荧光，并且随着母体的滴度而增加而呈现出不同程度的荧光。利用这个方式，就可以在凝胶中被分离出来的不同长度的DNA或RNA进行定量和检测。