先天性心脏病的治疗费用3一5万元左右，按国家规定都会报销，但报销比例因为当地财政补贴以及民政局的政策不同而有所差异。
一般报销比例在总费用80%左右，有的地方会全部报销，有的地方规定在指定医院手术治疗全部报销，而不在指定医院手术的则不予报销或部分报销。
具体建议去当地医院心脏外科和民政局去详细了解。
小儿先天性心脏病民政局是没有义务报销的，如果入了居民医疗保险，可以纳入报销的范围，在贫困地区，小儿先天性心脏病可以得到免费治疗，可以去当地红十字会进行申请。
目前全国各地对先天性心脏病的报销政策基本上是各地自行制定的，一般有以下几个方面：
一、医疗费用报销标准：政府报销标准针对本地民众，全额报销一般是按分级医疗标准享受。
二、政府间报销：有些地区针对先天性心脏病，政府会拨付一定的资金给家庭，用于支付护理费用、药费等相关费用。
三、失能扶助政策：政府会提供失能人扶助政策，为有特殊疾病的患者及其家属提供必要的经济支持。
四、信用卡费用报销：部分政府规定，先天性心脏病患者可以申请医疗信用卡，全额报销必要的医疗费用。另外，一些银行也会向先天性心脏病患者提供特殊报销服务，以支持他们医疗费用。