深圳护照和港奥通行证可以同时办理，因为两者的用途和适用范围不同，不会相互干扰。深圳护照是一种国际旅行证件，适用于出境旅游、商务洽谈等；而港奥通行证则是一种赴港澳地区（包括香港、澳门和珠海）通行证件，适用于前往这些地区的短期旅游、探亲、商务等。因此，如果需要这两种证件，可以同时办理，保证自身的出行需求。
深圳护照和港奥通行证可以同时办理。深圳护照可以作为出入境中国内地的证件，港奥通行证可以让持证人在前往香港和澳门时不需要申请签证，具有不同的使用场景和优势。
持有者可以依据自己的需要，选择办理其中一个或两个证件，但必须符合对应证件的申请要求。