第一、转移到原户籍的人才中心，第二、保留在学校，第三、交给本人保管。个人档案是一个人一生生命轨迹的缩写，是用人单位了解一个人情况的非常重要的资料，也是一个人政治生涯中的重要组成部分，绝不可小看和忽视。
办理退学后，学校会处理本校学籍，定时上报学信网，一般在7~15天左右，会注销在籍学籍，如果超过这个时间还没注销，可以联系学校，申请快速办理。
根据《普通高等学校学生管理规定》，按照国家招生规定录取的新生，持录取通知书，到校办理入学手续，复查合格者予以注册，取得学籍。复查不合格者，由学校区别情况，予以处理，直至取消入学资格。
学校在学生退学时应退还所缴学费，但具体情况会根据不同原因有所区别：
如果学校因违反国家规定或刊登、散发虚假招生简章等行为导致学生退学，学校应全额退还学生所缴费用，并依法承担赔偿责任。
学生注册缴费后未入读的，学校应退还所缴学费、住宿费的90%。学生在校经批准转学、中途死亡或因病休学、退学的，学费、住宿费按学生实际在校时间清退，未满一个月按一个月计算。如果学生私自离校或因自身原因被学校按规定开除学籍，或因触犯法律、法规不能继续接受教育，所交学费、住宿费不予清退。
如果学生已经领取了书本等，在退费时，可以扣除相应的费用。如果没有发生实际费用，应该全额退回学费。
如果学校不退学费，学生可以尝试和学校协商解决，协商不成可以向教育部门投诉或通过法院起诉。
综上所述，学校在学生退学时原则上应退还学费，但需扣除已发生的费用，如书本费等。如果学校不按规定退还学费，学生有权利通过协商或法律途径要求退还。