这是合法的保证金有多有少，是根据这个犯罪人员的有关风险程度来收取的，也是有国家的规定的，不是公安局想怎么收就怎么收，也就是说有一致性的规定，也就是说对他的风险等级进行评估以后进行收取一定的保证金。
意味着被取保候审者违反了相关规定而被扣除保证金3000元。有关法律规定，被取保候审者在取保候审期间要遵守相关规定，比如未经执行机关批准不得离开所居住的市、县;住址，工作单位或联系方式发生变化的，在24小时内向执行机关报告;不得以任何形式干扰证人作证;不得毁灭、伪造证据或串供。
如果违反以上规定之一的，取保候审结束后，凭解除取得候审的通知或者有关法律文书到银行领取退还保证金的同时，扣除3000元。
取保候审保释金的退还时间根据不同地区的规定和审核程序而异。通常情况下，保释金需要在案件审结后进行审核，确认未发现其他违法行为后方可退还。因此，退还期限较长，一般需要几个月或更长时间。在退还保释金的过程中，需注意遵守相关程序和规定，以确保资金操作合规和安全。