上海地铁致歉信是否能作为迟到证明，主要取决于公司的态度和相关规定。根据现有的信息：

地铁公司提供的致歉信：某些情况下，地铁公司可能会为乘客出具地铁晚点道歉信，这在一定程度上可能让因地铁晚点而迟到的上班族免于处罚1。然而，这并不意味着地铁致歉信具有强制性法律效力，即可以作为迟到证明2。

法律法规与特殊情况：在极端天气等不可抗力的条件下，职工因气象灾害红色预警造成误工的情况下，用人单位不得对职工作出迟到、缺勤的处理2。此外，如果是因为地铁故障导致的延误，可能需要考虑到相关法律因素，如是否有官方的停运通知或其他证据表明该延误属于不可预见且不可避免的情况2。

社会接受程度：在实际操作中，有些公司和社会公众可能会接受地铁致歉信作为迟到证明，尤其是在地铁运营出现问题并导致大量乘客迟到的情况下3。但这并不是普遍接受的规则，而是具体情况下的灵活做法。

综上所述，上海地铁致歉信是否被视为迟到，需要根据具体的公司政策和个人所在单位的态度来决定。在没有明确的法律规定或者公司内部规定支持的情况下，仅凭一份地铁致歉信通常不足以作为迟到证明。如果有争议，可以向相关的劳动争议调解机构寻求帮助