玛瑙的主要成份是二氧化硅SiO2，在高中课本中是晶体。因为含少量杂质，所以有各种颜色的玛瑙。玛瑙在自然界中含量稀少。
玛瑙是一种微晶质矿物，不是典型的晶体。它是由微小的晶体颗粒组成，其中包含许多大小与形状不一的晶粒。这些晶粒在玛瑙的生长过程中会产生错位，形成黑色或白色的纹理，给人以美感。虽然玛瑙不是典型的晶体，但它仍然拥有着晶体的一些特征，比如具有固定的化学组成和结构规律。由于玛瑙的微晶质结构，它比光线的波长要小很多，因此玛瑙会产生独特的光学效应，如带彩虹色的闪烁光芒。
玛瑙多数发布在山上面南朝北的山的阴面。
玛瑙石产地分布在我国西藏山南地区，辽宁省阜新市阜新县、彰武县，黑龙江逊克县宝山乡，宁夏沙漠中，南京市，江苏省仪征市，湖北宜昌等地。
1、西藏玛瑙石
产于西藏喜马拉雅山脉。该石质地坚实细腻，晶莹剔透；色彩斑斓，饱满光亮；纹路清晰，多有天然图案。
产于西藏山南地区的天然水草玛瑙，色泽鲜艳，美丽典雅，里面的水草絮状物为天然矿物质成分。
另有俗称玛瑙石的天珠原石，属于九眼石页岩，是沉积岩的一种，为薄页片状岩石，含有玉质及玛瑙成份，硬度7～8.5度，蕴藏于平均海拔4000米以上的喜马拉雅山域。
2、辽宁玛瑙石
产于辽宁省阜新市阜新县、彰武县。该石质地细腻，色泽光艳缤纷，纹理瑰丽，晶莹剔透，天然丽质，是艺术雕刻之佳材。阜新是中国玛瑙主要产地，其玛瑙石的开采利用已有8000年历史，历经辽代、清代两个繁荣时期，乾隆年间为全盛时期。