新农合和城镇医疗保险的报销比例并不完全相同。两者的区别主要体现在以下几个方面：

1. **参保人群**：新农合主要针对的是农村户口居民，而城镇医疗保险则主要覆盖城镇户籍的居民。

2. **报销目录**：新农合可报销的医药目录比城镇医保要少，这意味着某些药品或治疗可能不在新农合的报销范围内。

3. **报销比例**：在乡镇医院，新农合的报销比例较高。但在市级医院，新农合的平均报销比例通常比城镇医保低百分之一二十。此外，新农合的最高封顶金额也比城镇医保要少。

4. **待遇侧重点**：城镇居民医保主要保障住院和门诊大病，同时也兼顾普通门诊，因此其住院及门诊大病待遇通常都要高于新农合。而新农合的门诊待遇水平则要高于城镇居民医保。

5. **管理与筹资**：城镇居民医保主要由人社部门管理，而新农合在多数地方由卫生部门管理。在筹资方面，新农合成为农民医疗互助共济制度，采取个人缴费、集体扶持和政府资助的方式筹集资金。

总的来说，新农合和城镇医疗保险在报销比例、参保人群、报销目录等方面都存在一定的差异。因此，当选择医疗保险时，建议根据个人的实际情况和需求进行选择。