凌晨两点十三分的一声巨响可能由多种原因引起。其中，最常见的可能是音爆。音爆，也称为声爆，通常发生在飞行器（如超音速飞机）以超过声音的速度在空气中移动时。飞行器前方的空气受到强烈压缩，形成一道压缩波，当这道波传播到地面时，就会发出巨大的响声。此外，也有可能是地震、爆炸、建筑物倒塌等原因引起的巨响。

请注意，巨响的具体原因可能因地区和时间的不同而有所差异。如果您对巨响的原因感到担忧，建议您联系当地的应急管理部门或警方，以获取更准确的信息和指导。