如果西红柿栽深了，需要及时采取措施。首先要轻轻松动土壤，把根系稍微向上抬一抬，以便根系能够呼吸。然后浇水，使土壤保持湿润状态，帮助根系生长。
如果西红柿已经长成了幼苗，可以考虑进行根部修剪，去除过深的根部，以便新的根系能够正常生长。同时，在后续的栽培中，要注意控制土壤湿度，避免过度浇水，防止发生烂根现象。
西红柿根部发芽可能是由于以下几种原因：
1. 种植环境湿度过大：西红柿喜欢湿润的环境，但是过度的湿度可能会导致根部发芽。因此，种植西红柿时应保持适当的湿度，避免过度浇水。
2. 光照不足：西红柿需要充足的阳光才能正常生长。如果光照不足，可能会导致西红柿根部发芽。
3. 营养过剩：如果土壤中的营养物质过多，也可能会导致西红柿根部发芽。因此，施肥时应按照推荐的用量进行，避免过度施肥。
4. 温度过高或过低：西红柿对温度有一定的要求，过高或过低的温度都可能导致西红柿根部发芽。因此，种植西红柿时应保持在适宜的温度范围内。
若西红柿栽得过深，会导致其生长不正常，土壤通气不畅，根系容易腐烂。在这种情况下，需要及早进行调整。可以增加下面的泥土，使西红柿变浅，还需要注意保持土壤湿润，但不要过度浇水。如果你已经发现西红柿的根部已经腐烂，那么就需要将病株拔除，重新种植。因此在种植西红柿时，最好将它的高度设置在土壤表面的适合的深度，并确保其能够正常生长。