《某科学的超电磁炮》（简称《超炮》）是一部融合了多种元素的作品，包括校园生活、科幻背景、热血情节以及角色间的情感纠葛等。该系列动画的主线剧情清晰明了，每一季度都有明确的主题和目标。

第一季的主要内容围绕御坂美琴和其他角色的日常生活展开，直到第四话遇到了关键人物上条当麻和他的朋友木山春生及幻想御手。随着事件的推进，观众了解到幻想御手的真正目的，即唤醒被用于LV6实验的孩子们。这一部分的内容涉及到了寻找真相、揭示阴谋以及解救被困孩子的过程。

第二季的故事则涉及到另一个独立的线索，即御坂美琴克隆出的姐妹“Sisters”。这部分剧情描述了克隆人与一方通行之间的冲突，以及美琴如何求助上条当麻来解决问题。此外，还提到了一个名为“Study”的组织创造了人造萝莉菲布莉，并与另一秘密组织“Item”有关联。

第三季的剧情相对简洁，主要是关于人造人“Sisters”的LV6实验失败，以及美琴如何介入此事来拯救克隆人。这一季还引入了新的角色如人造人菲布莉，以及与之相关的两个暗部组织“Study”和“Item”，这些组织与《魔法禁书目录》等其他作品有所关联。

综上所述，《某科学的超电磁炮》是一个复杂且多元化的故事，每个季度都有各自独特的故事线和主题，但它们共同构成了一个连贯的世界观和主角们的成长历程。