国家级自然保护区有18个：

1.兴隆山国家级自然保护区，位于兰州榆中县；

2.祁连山国家级自然保护区，跨武威、张掖两地区和金昌市部分地区；

3.敦煌西湖国家级自然保护区，位于甘肃省敦煌市西部；

4.安西极旱荒漠国家级自然保护区，位于酒泉市瓜州县境内；

5.民勤连古城国家级自然保护区，位于武威市民勤县；

6.白水江国家级自然保护区，位于甘肃省南部陇南的文县、武都县；

7.莲花山国家级自然保护区，跨东南部的康乐、临潭、卓尼、临洮、渭源5县接壤地区，坐落在甘肃省甘南临潭县北部的八角乡境内；

8.尕海、则岔国家级自然保护区，位于甘肃省甘南碌曲县境内；

9.太统、崆峒山国家级自然保护区，位于甘肃省平凉市城西12公里处；

10.连城国家级自然保护区，位于兰州市永登县境内；;

11.小陇山国家级自然保护区，位于甘肃省东南部陇南、徽县、两当县的交界处；

12.盐池湾国家级自然保护区，位于甘肃酒泉、肃北蒙古族自治县东南部祁连山区；

13.安南坝野骆驼国家级自然保护区，位于酒泉阿克塞哈萨克族自治县境内；

14.太子山国家级自然保护区，位于临夏回族自治州与甘南藏族自治州之间；

15.洮河国家级自然保护区，跨甘南藏族自治州的卓尼、临潭、迭部和合作四县境内；

16.敦煌阳关国家级自然保护区，位于甘肃省敦煌市南湖乡境内；

17.张掖黑河湿地国家级自然保护区，跨张掖市甘州、临泽、高台三县区；

18.黄河首曲国家级自然保护区，位于甘南州玛曲县。