1、概念不同：
直辖市是直接由中央政府所管辖的建制城市，自治区是一种行政区划名称，在我国成立初期对民族自治地方统称为自治区；
2、人口数量不同：
直辖市往往需要较多的居住人口，而自治区相对直辖市而言人口少一些。
3、区域不同：
直辖市通常在全国的政治、经济和文化等各方面上具有重要地位。而自治区的行政地位相当于省，所以自治区其实也可以理解为有自治权的省。
区别：行政级别不同、地域不同、经济结构不同、生活水平不同。直辖市地理面积比省小。直辖市的工业、第三产业占比一般比农业高，而许多省份的农业依然占有相当大的比重。直辖市的人均GDP一般高于其他省份。
直辖市
直辖市，是中国行政区划之一，行政地位与省、自治区、特别行政区相同，是中华人民共和国省级行政区。