是的，车主应该要回车牌。

原因是根据《道路交通安全法实施条例》第九十八条规定，车辆被交通管理部门扣留的，应当在扣留期满时，及时将车辆和车牌归还车主。

因此，遇到二轮摩托车被交警扣留后，车主应该及时找到扣留部门，按照相关流程完成手续，取回车牌，方可再次行驶该车。

此外，还需要提醒车主，被扣留的情况下，不要试图强行取车，也不要轻信不法分子的假扮取车手续，以免造成更大的损失和危害。