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在EXO中,缺失位指的是某个位置的基因座上没有检测到等位基因的情况。而基牙位通常指的是具有基因型信息的基因座位置。要将缺失位改为基牙位,通常需要进行基因型填充或基因型推断的过程。
基因型填充是一种基于参考基因组或其他相关个体的基因型信息来预测缺失位点的基因型的方法。这个过程可以通过统计模型、机器学习算法或参考基因组的信息来实现。基因型填充软件(如Beagle、FImpute等)可以利用已知的基因型数据来预测缺失的基因型,并将其填充到缺失位点上。
基因型推断则是一种更复杂的方法,它通常基于整个基因组的数据和其他个体的基因型信息来推断缺失位点的基因型。这种方法通常使用统计模型或机器学习算法,通过比较已知基因型之间的相似性和连锁不平衡等信息来推断缺失的基因型。