员工因患重大疾病主动离职，公司通常不需要支付补偿金。根据《劳动合同法》规定，员工离职时应该提前30天以书面形式通知公司。尽管公司不需要支付补偿金，但仍然需要出具解除劳动合同证明，并在15天之内为劳动者办理档案及社保转移手续。
因此，员工因患重大疾病主动离职，一般是没有补偿金的。
企业对于患重大疾病的员工处理，主要是两个要点：
1、医疗期的问题
依据现行法律规定，根据员工工作年限及入职年限给予3-24个月不等的医疗期限;且，对某些患特殊疾病(如癌症、精神病、瘫痪等)的员工，在24个月内尚不能痊愈的，经企业和劳动主管部门批准，可以适当延长医疗期，延长期限一般系一年为限;
对于法定医疗期的员工工资，企业依约支付，但最低不得低于最低工资标准的80%。
2、医疗期满后解雇的问题
对于可以治疗的疾病，可根据现行法律规定，在医疗期后不能从事原工作岗位，又不能从事另行安排的工作，企业可提前三十日或支付代通知金单方解雇，但需要支付经济补偿金;
对于难以治疗的疾病，在医疗期内医疗终结或医疗期满后，应当由劳动鉴定委员会参照工伤与职业病致残程度鉴定标准进行劳动能力的鉴定。
被鉴定为一级至四级的，应当退出劳动岗位，解除劳动关系，并办理退休、退职手续，享受退休、退职待遇;若为五级以上的，在医疗期内不解雇，但在医疗期满后，不能从事原工作，也不从事另行安排工作的，企业可提前三十日或支付代通知金单方解雇，但需要支付经济补偿金。