当EMS个人物品的价值超过1000元人民币时，需要办理商业报关或者选择将物品退回。具体步骤如下：

收到通知：海关会向收件人寄送一张通知单，收件人需要凭借此通知单和所需证件，前往通知单上指定的地点进行清关。

自行清关：

收件人可以选择自行前往指定地点清关。

如果选择自行清关，可以忽略通知单上的清关代理公司，直接按照通知单上的指示操作。

委托清关代理：

另一种方式是委托清关代理公司处理。这样做可以避免收件人亲自前往清关，但可能需要支付一定的清关代理费。

清关代理公司通常会提供网上转账服务，方便收件人支付费用。

退回选项：

如果觉得清关不划算，收件人还可以选择将物品退回。这通常需要至“退运窗口”直接退运。

退回的划算与否需要收件人自行决定。

EMS送货：

一旦完成清关手续，EMS便会将物品送货上门。

请注意，超过1000元人民币的物品需要办理商业报关，这是一个重要的步骤，以确保物品合法进入中国。