比较：

苏丹北部的的经济比南部苏丹的好，无论是教育 基础设施 医疗卫生等各方面都比南方好，和富庶的北苏丹相比，南苏丹十分贫穷落后，基础设施匮乏，相当于法国面积的领土上居然只有38公里铺设路面的公路，只有2%人口有小学文化程度，文盲率高达85%。

分离原因：原因之一是由于南方的黑人各族和北方的阿拉伯人历史上积怨深厚，南北苏丹文化不同源、同处一个国家的时间远短于各自分治的时间。

南苏丹独立的另一个重要原因，是当地人对石油收益分配的不满，认为南方出口石油，北方却获得利益，而公投的前提就是双方重新商讨石油收益分配比例，这项工作既艰难又充满风险，诚如英国《卫报》所指出的“石油会燃烧”，一旦处理不当，后果不堪设想。

南北苏丹对盛产石油的阿布耶伊地区存在争议，此次公投，该地区会自行投票选择加入南方或北方，如果措置不当，这里很可能成为摩擦和冲突的“火药桶”。

目前南方的石油都通过管道经北方的苏丹港出口，炼油设施也大多在北方，这些也是北方追求更多石油收益分配比例的底气，但南苏丹当局正积极筹划在国际援助下修建从南方通往肯尼亚

蒙巴萨港的输油管线，一旦修通启用，很可能谋求在石油问题上的南北“脱钩”，届时新的矛盾又将酝酿。不仅如此，尼罗河水源分配等问题历来是南北苏丹的“老大难”，却很少引起国际关注，一旦公决结束，国际监督减弱，“老大难”同样可能成为冲突的导火索。

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