一是对鱼类及生态环境的危害。在遭受电鱼的水域内，大鱼小鱼都被一网打尽，对水域生态环境造成严重破坏。特别是部分电鱼行为还会导致我国重点保护的水生野生动物如中华鲟、胭脂鱼等珍稀特有鱼类死亡，破坏我国水生生物的多样性指标。

二是对人类自身的危害。电鱼对人身也存在安全隐患，由于采用高压电捕鱼，危险性极大，而且电鱼器大都为小作坊生产的三无产品，稳定性、可靠性不过关，有时瞬间达到上千伏的高压。据统计，长江流域11省、市近四年中因非法电鱼已经导致超过30人死亡。